L’ADNc de rat (ADN complémentaire) est une copie sous forme d’ADN de molécules d’ARN dérivées d’échantillons biologiques de Rattus norvegicus et obtenue par transcription inverse. Puisque l’ADNc est dérivé de l’ARN et non de l’ADN génomique, il fournit des informations de séquence correspondant aux transcrits présents dans l’échantillon de départ, notamment aux régions codantes des transcrits codant pour des protéines ainsi qu’aux séquences issues des ARN non codants. L’ADNc est largement utilisé en biologie moléculaire pour l’analyse de l’expression génique, la caractérisation des transcrits, le séquençage et le clonage.

Les études transcriptomiques chez le rat ont mis en évidence une importante diversité des transcrits associée aux tissus ainsi que des mécanismes de traitement alternatif de l’ARN, soutenant l’utilisation des ressources d’ADNc de rat pour les recherches sur les transcrits et la génomique fonctionnelle. Toutefois, la représentation des transcrits dans l’ADNc peut être influencée par la quantité d’ARN utilisée comme matrice, le choix des amorces, l’activité de la transcriptase inverse et d’autres facteurs expérimentaux. L’ADNc ne doit donc pas être considéré comme une représentation quantitative exacte de la population d’ARN initiale.

Caractéristiques principales

• Séquence spécifique du rat : Dérivée d’ARN de Rattus norvegicus pour les études moléculaires spécifiques de l’espèce.

• Représentation des transcrits : Fournit des copies ADN de séquences dérivées de l’ARN et permet l’analyse de la structure des transcrits, des variants d’épissage et de la diversité des transcrits.

• Compatibilité avec les applications de biologie moléculaire : Adapté à l’amplification par PCR, au séquençage, au clonage et à d’autres workflows fondés sur l’ADN.

• Accès aux séquences codantes : Peut fournir des séquences de régions codantes issues de transcrits codant pour des protéines pour les études moléculaires et fonctionnelles en aval.

Applications de recherche usuelles

• Analyse de l’expression génique : L’ADNc est couramment utilisé comme matrice pour la RT-qPCR et les workflows apparentés de quantification des transcrits.

• Analyse des transcrits et des isoformes : Permet l’étude de la structure des transcrits, de l’épissage alternatif et de la diversité des transcrits.

• Clonage et expression génique : Permet l’isolement ou le clonage de séquences codantes pour leur caractérisation fonctionnelle et les études d’expression de protéines hétérologues.

• Séquençage et transcriptomique : L’ADNc est utilisé comme intermédiaire dans de nombreux workflows de RNA-seq et de préparation de banques transcriptomiques, bien que certaines approches de séquençage reposent sur le séquençage direct de l’ARN.