Les sondes de dénombrement des chromosomes sont conçues pour l'identification et le dénombrement des chromosomes humains dans les cellules en interphase et comme complément au caryotypage standard en métaphase. Ces sondes produiront des signaux nets et lumineux spécifiques à chaque chromosome individuel. 

Étant donné que plusieurs chromosomes partagent les mêmes séquences répétitives, ce qui entraîne des signaux d'hybridation croisée, ils ne peuvent pas être différenciés par des sondes spécifiques aux centromères. Ces chromosomes peuvent au contraire être identifiés par des sondes spécifiques marquées directement, qui s'hybrident à proximité des séquences d'ADN satellites respectives ou d'autres loci spécifiques aux chromosomes.

La sonde 2q11 est spécifique de la région du gène AFF3 (famille AF4/FMR2, membre 3) dans 2q11.2sur le chromosome 2. En raison des hybridations croisées des satellites alpha du chromosome 2 avec d'autres régions centromériques, les sondes spécifiques à 2q11 sont fréquemment utilisées pour la détection du nombre de copies du chromosome 2.