L’élimination des dépôts de calcium est essentielle pour la manipulation de certains tissus en histologie. La décalcification se fait habituellement entre les étapes de fixation et d’inclusion. Cette étape concerne évidemment les os mais également d’autres tissus contenant des zones de calcification. Un grand nombre de réactifs et de méthodes ont été développés pour la décalcification et chacun a ses avantages et ses inconvénients. Les principales méthodes utilisées sont basées sur l’utilisation d’acides d’origine minérale, d’acides organiques ou d’EDTA.

Les solutions de décalcification sont utilisées pour préparer les os et les tissus durs en vue d'une analyse au microscope. Le choix du réactif dépend de la dureté du matériel, de l'objectif du diagnostic et de l'analyse ultérieure. Le temps de décalcification est fonction de la taille et de la densité structurelle du tissu dur, ainsi que de la composition de la solution de décalcification.

Afin d’obtenir les meilleurs résultats possibles lors de la décalcification de tissus, il est très important de déterminer le point auquel la décalcification est complète. Une décalcification incomplète peut entraîner des distorsions du tissu et endommagé le microtome lors de la coupe du tissu. Une décalcification trop forte peut entraîner des problèmes au niveau de la coloration, en particulier pour la coloration des noyaux.