L’ADN génomique de rat est un ADN génomique purifié isolé de Rattus norvegicus, un modèle expérimental largement utilisé en génétique, physiologie, pharmacologie et recherche biomédicale. Les ressources génomiques du rat ont contribué à l’étude de la variation génétique, des caractères quantitatifs, des loci associés aux maladies et des relations génotype–phénotype entre différentes souches de laboratoire.

L’ADN génomique fournit une matrice pour les analyses moléculaires ciblant des régions génomiques spécifiques ainsi que pour les études à l’échelle du génome. Son adéquation aux applications en aval dépend de son intégrité, de sa concentration, de sa pureté et du contexte génétique ou de la souche de l’animal, car les variations de séquence entre les souches de rat peuvent influencer l’analyse et l’interprétation des génotypes.

Caractéristiques principales

• Espèce : ADN génomique de Rattus norvegicus.

• Matrice génomique : ADN génomique nucléaire contenant des séquences codantes et non codantes.

• Applications de recherche : PCR, génotypage, analyse des variants, séquençage et autres workflows de génomique lorsque la qualité de l’ADN répond aux exigences de la méthode utilisée.

• Importance de la souche : Les variants génétiques diffèrent entre les souches et sous-souches de rat et peuvent être pertinents pour les études comparatives et phénotypiques.

Applications de recherche usuelles

• PCR et génotypage : Détection d’allèles spécifiques ou de modifications génétiques introduites expérimentalement.

• Analyse des SNP et des variants : Caractérisation du contexte génétique et des différences entre les souches.

• Séquençage de l’ADN et séquençage du génome entier : Identification de variants de séquence et étude des déterminants génétiques des caractères complexes.

• Cartographie génétique et génomique comparative : Utilisation des données de génotypage pour étudier les régions génomiques associées à des phénotypes physiologiques ou pathologiques.