Les systèmes de détection IHC basés sur la méthode des polymères consistent en un polymère d'une enzyme active lié à un anticorps secondaire spécifique d'un anticorps primaire cible. Ce format permet d'augmenter de façon significative la quantité d'enzyme présente au niveau du site de localisation, et donc un signal plus important grâce à la transformation d'une plus grande quantité de substrat en précipité. De plus, ce système permet un protocole en une étape au lieu de deux avec le système ABC (anticorps biotinylé + complexe avidine - enzyme).

Il existe maintenant des kits de détection IHC polymère d'une nouvelle génération qui permettent d'amplifier le signal avec un protocole en 2 étapes. L'étape ajoutée peut faire intervenir un anticorps intermédiaire, un polymère helper ou un amplification d'anticorps. Quelque soit la méthode utilisée, le but de cette étape additionnelle est d'augmenter la quantité de polymère sur le site de l'antigène afin d'augmenter le signal.

Les kits de détection polymère anti-IgG de souris sont conçus pour détecter des anticorps primaires de souris sur tissus de rat, ils contiennent des anticorps secondaires anti-IgG de souris couplés à un polymère de molécules de phosphatase alcaline ou de HRP.

Les substrats de la phosphatase alcaline les plus couramment utilisés sont le Fast Red et le Permanent Red. Ces 2 substrats forment des précipités rouges insolubles dans l'eau lorsqu'ils sont hydrolysés par la phosphatase alcaline (AP). C'est pour cette raison qu'on les appelle communément des chromogènes. La localisation des protéines cibles se fait ensuite par visualisation en microscopie des précipités au sein du tissu.