Le séquençage nouvelle génération (NGS) se fait généralement à partir d'échantillons d'ADN « frais » issus de sang, de cellules ou d'autres échantillons. Cependant, certaines études nécessitent de partir d'échantillons FFPE, c'est-à-dire de tissus obtenus à partir de biopsies, fixés et inclus en paraffine. La méthode de fixation à la formaline permet de stocker l'échantillon à température ambiante pendant de nombreuses années en réticulant le contenu cellulaire des acides nucléiques et des protéines et en encapsulant l'échantillon dans de la paraffine.

Ces échantillons sont assez délicats à utiliser car ils contiennent un matériel génomique dégradé et/ou limité. De multiples facteurs entraînent une variabilité de la qualité de l'ADN isolé à partir d'échantillons FFPE, notamment les altérations chimiques qui se produisent sur les acides nucléiques au cours du processus de conservation, le manque de normalisation du processus de conservation et l'âge des échantillons stockés. La qualité de l'ADN servant de matrice à la construction des banques pour le NGS étant un facteur important dans l'obtention de résultats fiables, il est donc important de traiter les échantillons FFPE avec des réactifs spécifiques permettant d'obtenir une matrice ADN de la meilleure qualité possible. Grâce à ces réactifs, il est maintenant possible d'analyser des échantillons auparavant inaccessibles pour en tirer des données génomiques et des informations de grande qualité.