Le séquençage de cellule unique ou single-cell seq est une des techniques du séquençage nouvelle génération (NGS pour Next Generation Sequencing). Le single-cell seq permet de faire l’analyse de l’information génétique (ADN, ARN) à l’échelle d’une seule cellule grâce à une optimisation des technologies de séquençage nouvelle génération. Cette technologie permet ainsi d’étudier les différences cellulaires avec une résolution optimale et de comprendre la particularité d’une cellule au sein de son micro-environnement. 

Le principal défi pour ce type de séquençage est la préparation d’une banque à partir d’une très petite quantité d’acide nucléique. Pour cela les kits de préparation de banques pour le séquençage de cellule unique utilisent une technique d’amplification appelée MDA pour Multiple displacement amplification. Cette technique permet d’amplifier des femtogrammes d’acide nucléique pour obtenir des microgrammes de matériel utilisable pour le séquençage. Grâce à ces kits de préparation de banques, il est possible d’étudier de faire du séquençage WGA (Whole genome amplification) et WTA (whole transcriptome aplification).