qPCR pour la virologie et la parasitologie

La PCR quantitative en temps réel est utilisée  pour le diagnostic des maladies infectieuses ainsi que les maladies sexuellement transmissibles dues à des microorganismes pathogènes.

C'est surtout pour la détection de pathogènes difficilement cultivables, notamment les virus, que la PCR est devenue la méthode de référence.

La détection par PCR est souvent opposée à la détection d'anticorps. Les méthodes moléculaires, tout comme la détection d'antigènes, permettent un diagnostic dans la phase aiguë d'une maladie, avant l'apparition d'anticorps. La présence d'anticorps dans le sérum n'est en effet mesurable au plus tôt qu'après quelques jours (rubéole, varicelle), voire quelques semaines (virus respiratoires, maladie de Lyme). Dans la phase aiguë, une PCR positive démontre le plus souvent une infection, alors qu'une sérologie négative doit être répétée dans un délai adéquat pour mettre en évidence une séroconversion.

La PCR quantitative en temps réel permet de quantifier le génome des organismes pathogènes et donc non seulement de les détecter et d'établir un diagnostic mais aussi de suivre l'évolution et la réponse au traitement.