La protéine CRLF2 interagit avec IL7R pour former un récepteur de TSLP, dont la liaison active la signalisation cellulaire par les voies JAK / STAT. Environ 7% des patients atteints de leucémie lymphblastique aiguë à cellules B (B-ALL), et plus de 50% des B-ALL chez les enfants atteints du syndrome de Down portent des modifications impliquant le gène CRLF2. Ceux-ci comprennent les translocations t (X; 14) (p22,33; q32,3) ou t (Y; 14) (p11,32; q32,3) qui fusionnent le gène entier de CRLF2 à la région amplificatrice de la chaîne lourde de l'immunoglobuline (IGH-CRLF2). Une autre altération commune est une délétion interstitielle impliquant la région pseudoautosomale (PAR1) des chromosomes sexuels en amont de CRLF2, juxtaposant le premier exon non codant de P2RY8 à la région codante entière de CRLF2 (P2RY8-CRLF2). Ces réarrangements, souvent accompagnés de mutations JAK, entraînent une surexpression de CRLF2 et contribuent à la transformation lymphoïde. Les patients avec des réarrangements de CRLF2 et des mutations JAK ont une faible survie sans événement et globale. En outre, la détection de réarrangements de CRLF2 par FISH peut aider à sélectionner les patients B-ALL éligibles pour un traitement avec des inhibiteurs de la voie JAK / STAT.