Le gène suppresseur de tumeur VHL (von Hippel-Lindau tumor suppressor) est situé sur 3p25.3 et code une protéine de 30 kDa avec une activité d'ubiquitin ligase E3. La protéine est impliquée dans l'ubiquitination et la dégradation du facteur inductible par l'hypoxie (HIF), qui est un facteur de transcription jouant un rôle essentiel dans la régulation de l'expression des gènes par l'oxygène. La perte d'hétérozygotie (LOH) au niveau du chromosome 3p et l'inactivation du gène VHL par délétion ou mutation est la modification génétique la plus fréquente dans les carcinomes classiques des cellules rénales (CCR) sporadiques ou associés au syndrome du VHL, alors que des altérations de cette région sont rarement observées dans les CCR papillaires et chromophobes. Des études récentes suggèrent que la détermination du statut du gène VHL par la FISH peut améliorer considérablement la précision de l'évaluation des biopsies de tumeurs rénales, en fournissant des informations pronostiques qui peuvent guider les décisions de gestion.