Les tests de méthylation des histones permettent de détecter l’ajout de groupements méthyle sur les résidus lysine et arginine, régulant l’organisation de la chromatine et l’expression génique. Ces modifications génèrent des marques activatrices ou répressives selon la position du résidu et l’état de méthylation.
Méthodologies principales
- Western blot : utilise des anticorps spécifiques de site pour quantifier les niveaux de méthylation des histones.
- ELISA : mesure la méthylation globale ou ciblée à partir d’extraits nucléaires.
- Immunoprécipitation de la chromatine (ChIP) : cartographie les profils de méthylation sur différentes régions génomiques.
- Spectrométrie de masse : permet une analyse précise des modifications spécifiques de site et des profils combinatoires.
Rôles biologiques
- Les états mono-, di- et triméthylés exercent des fonctions régulatrices distinctes.
- H3K4me3 marque les promoteurs actifs et les sites d’initiation de la transcription.
- H3K27me3 induit la répression transcriptionnelle via les complexes Polycomb.
- H3K9me2/3 contribue à l’établissement des domaines d’hétérochromatine.
- H3K36me3 est associé aux corps géniques activement transcrits.
Applications
- Recherche sur le cancer : identification de profils de méthylation aberrants.
- Biologie du développement : suivi des états épigénétiques spécifiques aux lignages cellulaires.
- Criblage pharmacologique : évaluation des inhibiteurs de méthyltransférases et de déméthylases.
- Études de régulation génique : corrélation entre marques épigénétiques et activité transcriptionnelle.
- Recherche sur les cellules souches : suivi des processus de différenciation cellulaire.